Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PRUNE1-202ENST00000368934 2214 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ARNT-201ENST00000354396 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF562-202ENST00000453372 2111 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CEP112-201ENST00000317442 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC083806.1-201ENST00000468934 316 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AP005202.2-201ENST00000582386 658 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 U1.41-201ENST00000617626 165 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CLUL1-201ENST00000338387 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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