Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC097467.4-201ENST00000605504 141 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
COL19A1Q14993 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms