Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL359094.1-201ENST00000627944 566 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
CHD4Q14839 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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