Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
RUNX3Q13761 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
RUNX3Q13761 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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