Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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CUL1Q13616 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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CUL1Q13616 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LGI1-209ENST00000627699 664 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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CUL1Q13616 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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