Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
SRSF5Q13243 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SRSF5Q13243 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
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