Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
NME3Q13232 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms