Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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