Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC062021.1-201ENST00000429008 557 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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IFT88Q13099 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
IFT88Q13099 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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