Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPN13Q12923 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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PTPN13Q12923 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
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