Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
BPTFQ12830 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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