Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
RBBP4Q09028 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.1 ms