Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RPS29P62273 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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