Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CENPFP49454 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CENPFP49454 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CENPFP49454 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CENPFP49454 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CENPFP49454 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms