Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 CEP41-219ENST00000616628 3315 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 LINC00294-201ENST00000631190 3306 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 AKR1C1-202ENST00000380872 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRHP20396 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 BTN2A1-203ENST00000429381 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 PLAGL1-202ENST00000360537 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 CLK1-201ENST00000321356 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 MFSD8-218ENST00000641186 4448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR6793-201ENST00000612376 63 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC110998.1-201ENST00000519029 2053 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNRD1ASP-211ENST00000376797 3270 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 GSTCD-201ENST00000360505 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 MYO6-208ENST00000627432 4074 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
TRHP20396 FAM13C-216ENST00000618427 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF888-202ENST00000638862 4195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AKAP13-203ENST00000394518 13215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AMOT-202ENST00000371958 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 IKZF5-201ENST00000368886 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 MC2R-201ENST00000327606 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 ARHGEF9-234ENST00000637557 4775 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
TRHP20396 CCDC15-201ENST00000344762 3893 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
TRHP20396 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms