Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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