Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms