Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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