Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 TRAV31-201ENST00000502780 342 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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RTL8BQ17RB0 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RTL8BQ17RB0 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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