Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
IMPG1Q17R60 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
IMPG1Q17R60 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms