Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CHD2-201ENST00000394196 9363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LIPG-201ENST00000261292 10441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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HERC1Q15751 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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HERC1Q15751 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 TMEM132B-201ENST00000299308 10906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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