Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TMCO5A-205ENST00000559502 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
COL19A1Q14993 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms