Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RAB39AQ14964 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.1 ms