Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
COL4A6Q14031 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms