Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTCH1Q13635 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTCH1Q13635 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTCH1Q13635 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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