Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
TCOF1Q13428 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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