Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
GRIK2Q13002 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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