Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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PTPN13Q12923 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PTPN13Q12923 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
PTPN13Q12923 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
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