Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
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PGGT1BP53609 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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