Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 CLUHP1-201ENST00000435012 1190 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
ARID4AP29374 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC6.84□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms