Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRDP23468 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRDP23468 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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