Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTPRBP23467 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
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PTPRBP23467 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PTPRBP23467 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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