Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms