Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAPPC9Q96Q05 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms