Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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ZNF548Q8NEK5 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ZNF548Q8NEK5 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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