Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PKHD1-201ENST00000340994 11589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HERC1Q15751 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
HERC1Q15751 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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