Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PUM3Q15397 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PUM3Q15397 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms