Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RABEP1Q15276 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms