Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
CUL1Q13616 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CUL1Q13616 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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