Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC008250.2-201ENST00000615261 205 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
SF3B2Q13435 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
SF3B2Q13435 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.7 ms