Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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