Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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