Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MAPK10-241ENST00000639234 2985 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SAMMSON-222ENST00000641901 2727 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FCHSD2-203ENST00000409314 4509 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 DLEU2L-201ENST00000371086 3555 ntBASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC01108-201ENST00000427276 3152 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RAD51AP2-201ENST00000399080 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TMEM72-AS1-201ENST00000450287 3300 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 OR51A10P-201ENST00000307165 937 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PPIAP22-201ENST00000358455 498 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ERMN-202ENST00000409216 746 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 VNN3-205ENST00000417437 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC092573.2-202ENST00000437243 336 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC087752.2-201ENST00000521219 281 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 IGLVV-66-201ENST00000523818 341 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CLCN5-201ENST00000307367 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ROBO1-202ENST00000464233 6742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CASP10-208ENST00000448480 1603 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC002384.1-203ENST00000602761 3049 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FAM13A-AS1-202ENST00000511543 2453 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PROX1-AS1-202ENST00000433082 5266 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GTF2H3-212ENST00000543341 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ATP2C1-208ENST00000504948 4714 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 OR52K1-202ENST00000641528 5456 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HIST1H2BA-201ENST00000274764 516 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL590635.1-201ENST00000406314 586 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms