Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PTMAP1-205ENST00000455552 325 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC138811.2-201ENST00000567078 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC009955.2-201ENST00000597288 542 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MAPK10-280ENST00000641166 2684 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SLC13A1-204ENST00000539873 2222 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 HPSE2-204ENST00000404542 3681 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC093010.2-202ENST00000493033 3023 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ANKS1B-215ENST00000549493 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NUP155-207ENST00000513532 4088 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SELP-202ENST00000367786 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CACNB2-215ENST00000615785 3707 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 GPR151-201ENST00000311104 3088 ntAPPRIS P1 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DGKG-202ENST00000344484 3445 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RBM5-201ENST00000347869 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AP001922.2-201ENST00000530435 390 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF781-201ENST00000358582 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 DCX-208ENST00000636035 9269 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 MDM4-214ENST00000612738 9407 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 SORBS2-230ENST00000448662 4356 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
FOXC1Q12948 ZNF770-201ENST00000356321 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms