Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
CHRNEQ04844 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms