Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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PTPRAP18433 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
PTPRAP18433 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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