Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 C2orf80-207ENST00000453017 722 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 DCX-203ENST00000371993 9231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
PKHD1P08F94 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MLH3-201ENST00000355774 7896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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PKHD1P08F94 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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PKHD1P08F94 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
PKHD1P08F94 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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