Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PTPRCP08575 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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