Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AF001550.2-201ENST00000636643 217 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms