Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms